מבחן הצ'ונין הוא מבחן שמתקיים פעמיים בשנה, כדי לראות לאיזה גנין מבין כל הגנינים שבעולם, יש את היכולות המתאימות להיות צ'ונין. ברגע שגנין השלים את מינימום המשימות שהוא צריך (שמונה משימות), הוא יכול להכס לבחינה.

מבחני הצ'ונין מתקיימים גם בתור תחליף למלחמות בין הכפרים. פעם, הרבה מדינות של שינובי היו נלחמות אחת בשניה, וכתוצאה מכך מתו הרבה נינג'ות. מבחני הצ'ונין מאפשרים לאזרחים, מנהיגים ואנשים מכפרים אחרים ללא נינג'ות, לבוא לראות את הנינג'ות החזקות של כל כפר, ולעשות ביניהם הסכמי שלום והפסקות אש. הנינג'ה שמנצחת במבחן הצ'ונין מתקדמת בדרגתה מדרגת גנין אל תדרגת צ'ונין.

הכפר בו מתקיימים מבחני הצ'ונין בסדרה הוא כפר העלה. בדרך כלל לכפר שמקיים בתוכו את מבחני הצ'ונין יש יותר נינג'ות מאשר כפרים אחרים שבאים למבחנים ממקומות רחוקים, והם יכולים להכנס רק עם אישור מיוחד למבחנים.

הבחינה שהתקיימה בכפר העלה התחלקה לשלושה חלקים. החלק הראשון הוא בחינה על דף שבה היו 10 שאלות. החלק השני הוא מרוץ למרכז "יער המוות" לאחר שהקבוצה נלחמה בקבוצה אחת לפחות ויש לא את שני סוגי המגילות שהיא צריכה להביא איתה למרכז היער. החלק השלישי הוא תחרות שבה הנינג'ות נלחמים אחד בשני כדי להראות את יכולותיהם. שני השלבים הראשונים מתבצעים מיד אחר לאחר השני, בשונה מהם, השלב השלישי מתבצע כחודש אחר כך. במקרה שיותר מדיי אנשים סיימו את את השלב השני בבחינה, תערך במקום בחינה מוקדמת לשלב השלישי כדי לקצץ במספר העוברים לשלב השלישי. במוקדמות האלה כל נינג'ה ילחם בבחירה ראנדומאלית כנגד אויב אחר, עד שנשאר חצי ממספר האנשים כדי להמשיך לשלב הבא.

הבחינה הראשונה וחוקיה

הבחינה הראשונה של מבחן הצ'ונין היא בחינה על דף בו נמצאים 10 שאלות שעליהם צריכים לענות תוך שעה. הגנינים שמשתתפים בבחינה נאספים יחד אל חדר גדול אחד עד שמגיע הבוחן עם קבוצה עילית של צ'ונינים שנמצאים שם כדי לשים עין על הנבחנים ולסמן אותם אם הם מרמים.

החוקים בבחינה פשוטים: כל משתתף מתחיל עם 10 נקודות, כל שאלה במבחן שווה נקודה אחת. על כל תשובה לא נכונה הם מאבדים נקודה. אז כדי לשמור את הציון על 10 חייבים לענות נכון על כל 10 השאלות. הבחינה היא מאורע קבוצתי. ברגע שהבחינה מסתיימת, כל הציונים של חבריי הקבוצה יתחברו ביחד. חוץ מזה, בכל פעם שאדם נתפס מעתיק ע'י אחד הבוחנים הוא מאבד שתי נקודות. אם אדם נתפס 5 פעמים בחינתו נפסלת והוא וחבריי קבוצתו נדרשים לעזוב את מבחני הצ'ונין.

השאלה העשירית של הבחינה, שלא כמו האחרות, לא כתובה על דף. במקומה כתוב במבחן שהשאלה תיחשף לאחר 45 דקות מתחילת הבחינה.

לפניי שהבחינה מתחילה, כל משתתף מקבל תווית עם מספר עליה (בראנדומאליות), ועל פי המספר שעל התווית הם יודעים איפה לשבת (ככה הקבוצה מתפצלת), הבחינות מחולקות עם פניהם מופנות כלפי מטה, וכאשר קצין הבחינה נותן הוראה להפוך את הדפים, הנבחנים יכולים להפוך את הדפים ולהתחיל בבחינה.

תמצית הבחינה שהתרחשה בסדרה (*אזהרת ספוילרים למי שעוד לא ראה את בחינות הצ'ונין*)

הבוחן, מורינו איביקי, קפטן התחקורים והעינויים, של כפר העלה, מגיע אל אולם הבחינה ומיד מראה את הנוכחות שלו כשהוא מצווה על הנינג'ות מכפר הצליל להפסיק להשוויץ לפני הבחינה. איתו מגיעה חבורה של צ'ונינים, כל אחד מהם מחזיק לוח כתיבה קטן ועיפרון. ברגע שהם מגיעים מספר נינג'ות מבוגרות יותר של כפר העלה בדרגת גנין מתחילים לדאוג בגלל שאיביקי הוא הבוחן.

כל גנין קיבל מספר מיוחד, ואז הלך לכיסא בו היה כתוב המספר, הבחינות מונחות עם פניהם מטה כאשר איביקי הסביר את חוקי הבחינה, באי סדר שרבט אותם על הלוח השחור שהיה על הקיר.

לאחר שניתנה ההוראה להתחיל, בשעה 17:30, החלק המתוחכם והסודי של הבחינה התחיל לעבוד, חלק מהנבחנים התחילו לענות על השאלות על פי הידע שלהם, וחלק הבינו שהם לא יכולים לענות על השאלות בצורה הזו.

נארוטו עבר על המבחן והתחיל בשאלה מספר 1, בשאלה זו הופיעה הודעה בכתב סתרים, סאסקה וסאקורה גם התחילו לענות על הבחינות שלהם, תוך כדי דאגות כלפיי נארוטו. סאסקה הבין שהוא לא יכול לענות על שום שאלה מתוך השאלות שבבחינה, וסאקורה התנחמה בזה שהרבה אנשים בבחינה לא יצליחו לענות על השאלות במבחן, למרות שהיא עצמה יכלה.

סאסקה הבין את הכוונה האמיתית של המבחן הזה: לרמות... בלי להתפס!. הוא הבין שהבחינה הזו לא נועדה כדי לבדוק את הידע, אלא כדי לבדוק את היכולת לאסוף מידע בחשאי. חלק מהנינג'ות כבר התחילו להעתיק: גאארה יצר עין מחול, ושלח אותה אל אחד המשתתפים בבחינה, הוא גרם לחול להכנס לאותו המשתתף לעין כדי שלא יוכל לראות שמעתיקים ממנו, ואז העתיק את התשובות. אקאמרו התחיל לנבוח לקיבה את התשובות, שינו שלח את אחד החרקים שיעתיק את התשובות, טנטן שמה מראות על אחת המנורות בתקרה, והשתמשה בקונאים וחוטים כדי לראות בהשתקפות שלהם את התשובות של אנשים אחרים, ואז כיוונה את הזווית של הקונאים שוב, כדי שרוק לי יוכל לראות אותם ולהעתיק את התשובות,דוסו מקשיב בדריכות לרעשים שהאיש שממולו עושה עם העיפרון כשהוא כותב, נג'י משתמש בביאקוגאן כדי לראות דרך נינג'ות שמולו ולהעתיק את התשובות, וסאסקה משתמש בשארינגאן שלו כדי להעתיק את התנועות של אחד הנינג'ות שנמצאים מולו.

בזמן הזה, הצ'ונינים הבוחנים מסמנים בדפים שלהם בכל פעם שהם שמים לב לפעילויות חשאיות, וחלק מהאנשים נתפסים. באותו הרגע הם נפסלים ביחד עם שאר חברי קבוצתם. נארוטו מחליט שהוא לא הולך לרמות, הוא הולך לחכות לשאלה האחרונה ומבסס את תקוותיו עליה, באותו הזמן, הינאטה, נינג'ה אחרת מכפר העלה, מציעה לנארוטו לראות את הבחינה שלה.

סאסקה וסאקורה מסיימים לכתוב ואז מספר אנשים אחרים נכנסים לפעולה. אינו שמה לב שסאקורה סיימה לכתוב, והיא משתמש בטכניקת החלפת המוחות שלה על סאקורה, ונכנסת לגופה לרגע. כשהיא מסיימת להעתיק היא חוזרת בחזרה אל גופה שלה, ואז היא נכנסת אל גופו של צ'וג'י כדי לכתוב את התשובות אצלו גם. קאנקורו מבקש ללכת לשרותים והוא מלווה ע'י צ'ונין לשם. כשהוא מגיע לשם הצ'ונין נהפך לבובה של קאנקורו, הבובה מגלה לו את כל התשובות שהיא זוכרת. הוא גם מכין עותק כדי לתת לטמארי בדרך חזרה למקום בו הוא יושב. הוא מגיע בדיוק בזמן לשאלה העשירית לה נארוטו מחכה בחוסר סבלנות.

השאלה העשירית לא היתה פשוטה כמו שנארוטו חשב שהיא תהיה. איביקי התחיל להסביר את החוקים הספציפים שחלים על שאלה זו. חוק מספר אחד, המשתתפים בבחינה חייבים לבחור אם לקחת את השאלה או לא, אם הם לא יקחו את השאלה, הנקודות שלהם ירדו לאפס, והם יכשלו ביחד עם שאר חברי קבוצתם. חוק מספר שתיים, אם הם כן יקחו את השאלה, אבל יענו תשובה לא נכונה, הם יאבדו את הזכות שלהם להשתתף אי פעם במבחני הצ'ונין. קיבה התפרץ ואמר שיש אנשים שעשו כבר את הבחינה פעם והם יודעים את התשובה, איביקי צוחק ואומר לנבחנים שהם חסרי מזל כי השנה החוקים בבחינה זו הם החוקים שלו. לחלופין, הם יכולים לבחור לא לעשות את השאלה, וביחד עם חברי קבוצתם, לעשות את הבחינה בשנה הבאה.

כולם התחילו להלחץ, בזמן שחשבו על שתי האפשרויות הגרועות שניתנו להם כי הם לא רוצים לתת לחברי הקבוצה שלהם להתאכזב מהם, או להשאר בדרגת גנין לשאר חייהם. נארוטו שוקל לפרוש אבל הוא לא מחליט, בזמן שאנשים אחרים מרימים את ידיהם ופורשים... המספרים שלהם נקראים והם עוזבים את האולם ביחד עם חברי קבוצתם. סאקורה עושה החלטה: למרות שהיא בטוחה שהיא יכולה לענות על השאלה, היא חושבת על נארוטו ומחליטה שהיא לא רוצה לראות את החלום שלו מתפוגג. היא מתחילה להרים את ידה עם חיוך מובך על פניה. אבל היא עוצרת ברגע שהיא רואה את היד של נארוטו מתרוממת. סאסקה, הינאטה וסאקורה בשוק, אבל ברגע שהם חשבו שהוא פורש, הוא מכה עם ידו שהרים למעלה על  השולחן, ובצעקה אומר שהוא לא פוחד מהשאלה העשירית.

איביקי, שמכיר את מוחו ומחשבתו של האדם בצורה מושלמת, מבין שנארוטו גירש את הפחד של כולם מהאולם. כולם חייכו אל נארוטו שנחוש לקחת את השאלה העשירית, גם אם הוא ישאר גנין לנצח. אחרי מה שנארוטו אמר, אף אחד אחר לא פרש. איביקי אמר שאין טעם לחכות עוד.